蛋白质翻译的起始阶段(二)
【答案】：蛋白质的生物合成包括翻译起始、肽链延伸、肽链的终止及释放3个大的阶段。（1）翻译的起始，包含三步：第一步，30S小亚基首先与翻译起始因子IF和IF3结合，通过SD序列与mRNA模板相结合。
编码蛋白质的II类基因启动子在结构上有共同的保守序列，多数II类启动子有一个被称为TATA盒的共有序列，通常处于-30区，相对于转录起始位点的位置比较固定，也有一些II类启动子不含有TATA盒，这样的启动子称为无TATA盒启动子。
起始 在翻译的起始阶段，还需有3种蛋白质因子 —— 起始因子（IF）的参与，即IFIFIF3。此时核糖体的P位被起始氨酰-tRNA占据，A位空着，等待能与第二个密码子匹配的氨酰-tRNA进位。
二）真核生物翻译起始 起始因子eIF-2B、eIF-3与核糖体小亚基结合，在eIF-6参与下，促进80S核糖体解离成大、小亚基。eIF-2与起始Met-tRNAiMet和GTP结合，共同结合对应于小亚基P位的起始位点。eIF-4A、eIF-4B、eIF-4E、 eIF-4G与mRNA5’帽子结合。
翻译是蛋白质生物合成（基因表达中的一部分，基因表达还包括转录）过程中的第二步（转录为第一步），翻译是根据遗传密码的中心法则，将成熟的信使RNA分子（由DNA通过转录而生成）中“碱基的排列顺序”（核苷酸序列）解码，并生成对应的特定氨基酸序列的过程。
翻译的产物是蛋白质，蛋白质生物合成的第二步是翻译。翻译所需的原料包括tRNA、mRNA、酶、21种氨基酸、核糖体和能量。mRNA是翻译的模板。基因表达包括转录、RNA剪接、翻译后修饰。翻译大致分为三个阶段：起始、延长和终止。
人类偏肺病毒藏身之谜揭开
N6-甲基腺苷修饰是RNA最常见的修饰之一，但科学家对其生物学作用并不清楚。美国一项最新研究发现，人类偏肺病毒的m6A修饰可帮助病毒成功隐藏起来，不被免疫系统发现，进而促进HMPV的复制和基因表达。
这种病毒可能起源于动物，如牛、鹿等，还有更强的适应性和传染性，这也是导致它传播的主要原因。国内出现了这个热门话题，引起了广泛的社会关注。据了解，这主要影响肺部，严重者可能出现呼吸系统衰竭。这是一种由轮状病毒引起的新型疾病，症状和表现包括发热、咳嗽、呼吸急促等。
什么是hMPV人偏肺病毒（hMPV）是一种在2001年被发现的通过密切接触传播的人类呼吸道病毒，可引发普通感冒症状，如流鼻涕、咳嗽和轻度发烧。对于特定人群，其症状可能更为严重。 hMPV的普遍性据美国肺脏协会，hMPV是儿童上呼吸道感染的常见原因，估计10%至12%的儿童呼吸道疾病与此有关。
HMPV，全名人类偏肺病毒，是由荷兰学者于2001年首次在儿童呼吸道感染中发现的一种病毒。对于HMPV是否不为人知，这个问题有些夸张，它并非新病毒。媒体报道中提及的百天死亡率43%，数据来源存在问题，实际上这种数据拼凑方式可能会误导读者。
hmvp是人类偏肺病毒。人类偏肺病毒（Human Metapneumovirus，简称HMPV）是一种引起呼吸道感染的病毒，属于单股负链RNA病毒家族。HMPV最早于2001年从儿童呼吸道样本中分离出来，并被确认为一种新的病毒。HMPV感染主要发生在冬季和春季，尤其是对于婴儿和幼儿来说，是一种常见的呼吸道病原体。
HMPV是指人类偏肺病毒（Human Metapneumovirus），也被称为副黏液病毒或人副流感病毒。HMPV是一种呼吸道病毒，属于副黏液病毒科，与呼吸道合胞病毒（RSV）相似。它主要感染婴幼儿、老年人以及免疫系统较弱的人群。
1-甲基腺苷(m1A)检测
研究表明，1-甲基腺苷（1-methyladenosine， m1A）和1-甲基次黄苷（1-mel）联合检测膀胱癌具有很高的灵敏度和特异性。由m1A58甲基转移酶（hTrm6P/hTrm61P）催化tRNA58位的腺苷（A）生成，其中hTrm61p由TRMT61A基因编码，是其中的催化亚基。在后续实验中发现TRMT61A，hTrm61p在膀胱癌组织中高表达。
简介：RNA甲基化是RNA分子上的化学修饰，通常在RNA转录后，由RNA甲基转移酶催化，将甲基化修饰转移到RNA碱基上，包括N6-甲基腺苷（m6A）、N7-甲基鸟苷（m7G）、N1-甲基腺苷（m1A）、甲基化腺苷（m6Am）等修饰。
⑸抗PL-12抗体：即抗丙氨酰tRNA合成酶抗体，阳性率为3%，在非肌炎患者中抗PL-7和PL-12抗体均属罕见，两者与J0-1抗体相关的疾患为同一亚类肌炎。
mRNA最常见的内部修饰包括了N6-腺苷酸甲基化（m6A）、N1-腺苷酸甲基化（m1A）、胞嘧啶羟基化（m5C）等。N6-甲基腺嘌呤（m6A）在 mRNA 内部修饰碱基中所占比例最大，主要分布在 G（m6A）C （70%）或者A（m6A）C （30%）保守序列中。
甲基化简记——RNA、DNA与蛋白均可甲基化
甲基化：RNA、DNA与蛋白的化学修饰概览甲基化，作为表观遗传学的基石，涉及在DNA、RNA和蛋白质分子上添加甲基团（-CH3），影响它们的功能。以下是关于三种生物分子甲基化的详细介绍。RNA甲基化RNA甲基化，如m6A修饰，发生在RNA转录后，通过RNA甲基转移酶催化。
简介：RNA甲基化是RNA分子上的化学修饰，通常在RNA转录后，由RNA甲基转移酶催化，将甲基化修饰转移到RNA碱基上，包括N6-甲基腺苷（m6A）、N7-甲基鸟苷（m7G）、N1-甲基腺苷（m1A）、甲基化腺苷（m6Am）等修饰。
性质不同 常染色质为染色质（由DNA、RNA和蛋白质组成）的一种松散聚集的形式，这种聚集方式在基因中大量存在，并且相应的片段通常处于活跃的转录当中（但并非必要，即常染色质部分不一定都是高表达的序列）。常染色质构成了细胞核基因组中表达最活跃的一部分。
三种常见的mRNA修饰
假尿嘧啶（ψ）是最丰富的RNA修饰，由尿苷异构化产生。mRNA上的假尿嘧啶化修饰可改变密码子，增强转录本稳定性，响应应激反应。2011年研究发现，mRNA上的假尿嘧啶化修饰能改变密码子。2014年，研究发现热休克时，额外引入超过200个假尿嘧啶修饰位点，敲除PUS7基因会减少这些含新引入修饰的mRNA。
【答案】：（1） mRNA的转录后加工：加帽添尾；内含子的剪接。（2） tRNA的转最后加工：反密码环的插入序列的剪接；5末端剪去一段核苷酸链；修饰反应形成稀有碱基；3末端添加CCA-OH。（3） rRNA的转录后加工：45S转录产物经剪接生成18S rRNA、8S rRNA、 28S rRNA，然后与核糖体蛋白形成核糖体。
N6-甲基腺嘌呤（m6A）作为动态调控mRNA加工、定位、翻译和降解的重要修饰，通过甲基转移酶和去甲基化酶的活性影响修饰水平，并招募特定结合蛋白发挥生物学功能。m6A修饰在mRNA选择性剪接、二级结构调控和出核过程中起作用，同时增强mRNA翻译效应，并参与加速mRNA降解。
SRAMP:哺乳动物m6A修饰位点数据库
综上所述，SRAMP数据库为研究者提供了预测哺乳动物m6A修饰位点的强大工具，有助于深入理解m6A修饰在RNA调控中的作用，为相关研究提供了重要支持。
m6A-Atlas是一个综合且全面的m6A数据库，拥有大量高可靠度的m6A位点信息，并标注了与转录和转录后机制（TF结合、RBP结合）的关联。这为研究m6A提供了宝贵的工具和资源。
SRAMP （cuilab.cn/sramp） - 预测RNA序列上的m6A修饰位点，适用于数据不充足的lncRNA和circRNA研究。 EWAS Data Hub （EWAS Datahub） - 提供75，344个样本的DNA甲基化芯片数据，涵盖多种组织类型和疾病。
异常的m6A修饰会导致多种疾病的发生，如肿瘤、神经性疾病、胚胎发育迟缓等。此外，非编码RNA，如lncRNA、tRNA、rRNA以及剪切体RNA，也会在转录前后经历大量的碱基修饰活动。近年来，关于RNA修饰的研究数量开始增多并逐渐形成了体系，但深入性机制研究仍需全球科学家们共同努力。
ψ-seq和RiboMeth-seq对假尿嘧啶化修饰和2-O-核糖甲基化修饰位点定位可达单核苷酸精度，但m6A位点定位精度仍有待提高。RNA修饰的技术研究需结合高通量测序技术，纳米孔技术作为一种单分子方法，显示了m6A的单碱基分辨率检测能力，可能成为同时检测不同RNA修饰的新范例。
首先，如果需要对m6A修饰位点进行严格的验证，可以用下面这个方法：m6A-IP-qPCR ，也叫MeRIP-qPCR，即 m6A抗体富集到带甲基化修饰的RNA，下一步使用qPCR直接对富集到的RNA进行定量 的一种技术。m6A修饰的过程，离不开 甲基转移酶（writer）、去甲基转移酶（eraser）和阅读蛋白（reader） 的作用。