细胞质基因发现过程
叶绿体和线粒体在进化过程中逐渐从原核生物中独立出来，形成了细胞质基因。这一过程体现了生物体在适应环境变化和优化能量利用过程中所展现出的适应性和灵活性。细胞质基因的存在使得细胞能够在不需要依赖细胞核DNA的情况下，独立进行某些关键功能的执行。
年，科学家用电子显微镜观察衣藻、玉米等植物叶绿体的超薄切片，发现在叶绿体的基质中有长度为5nm左右的细纤维存在。用DNA酶处理，这种细纤维就消失。由此证明，这种细纤维就是叶绿体DNA。后来，科学家用生物化学的方法，证明了细胞的线粒体中也含有DNA。
除某些病毒的基因由核糖核酸（RNA）构成以外，多数生物的基因由脱氧核糖核酸（DNA）构成，并在染色体上作线状排列。基因一词通常指染色体基因。在真核生物中，由于染色体都在细胞核内，所以又称为核基因。
在细胞质基因中，根据它们存在于细胞器中的位置，可以分为质体基因、线粒体基因等。这些基因与存在于细胞核中的核基因同样遵循双螺旋结构，并通过半保留复制方式进行复制。值得注意的是，细胞质基因的遗传特征与核基因有所不同。
细胞质基因一般是指细胞质中细胞器和某些细胞质颗粒（原核生物和某些真核生物）中的遗传物质。卵细胞形成过程中，细胞质在初级卵母细胞形成卵细胞过程中就是不均等分配的。那细胞质中的细胞器和那些细胞质颗粒自然也不均等分配了。
细胞质基因与细胞核基因有哪些区别呢?
1、质基因与核基因区别为：位置不同、遗传方式不同、基因组不同。位置不同 质基因：是指细胞质中存在的一个个基因。核基因：是真核生物中位于细胞核内染色体上的基因。
2、不同点：细胞质基因数较少。G、C含量小，DNA结构是裸露的（没有蛋白质同它复合）环状双链DNA分子。细胞质基因在细胞分裂中的分配是随机的，基因通过雌配子传递，基因的定位也比较困难。而细胞核基因较多，DNA为线状，与蛋白质组成复合体，在细胞分裂中均等分配。
3、细胞质基因与细胞核基因在存在部位和基因数量上有明显区别。细胞核基因主要存在于细胞核内，而细胞质基因则主要存在于叶绿体、线粒体和某些细菌质粒中。在存在部位方面，细胞核基因和细胞质基因的分布有显著差异。细胞核基因位于细胞核中，而细胞质基因则位于细胞质中的叶绿体、线粒体和细菌质粒等细胞器内。
细胞质的遗传物质
细胞质的遗传物质是细胞质基因。细胞质基因：线粒体、叶绿体中的DNA上和细胞质粒上的基因。细胞质遗传现象表明，细胞质内具有控制某些性状的遗传物质——细胞质基因（简称质基因）。但是，科学家用电子显微镜观察，在细胞质内并没有找到像染色体一样的结构。
染色体外基因：也叫细胞质基因，是细胞器和细胞质颗粒中的遗传物质统称。质粒、卡巴粒、叶绿体基因、线粒体基因等。质粒：原核、细菌、小环DNA。松弛型和严紧型2类。线粒体基因：mtDNA，线状、环状，能单独复制，同时受核基因控制。哺乳动物：无内含子，有重叠基因突变率高。
细胞质也有遗传物质，遗传学内有一个概念叫做细胞质遗传，也称母系遗传、核外遗传。微生物内的细胞质遗传有细菌的质粒、草履虫的小核等，真核生物的细胞质内的线粒体、叶绿体内有独立的遗传物质。
也是DNA 细胞质和细胞核的遗传物质都是DNA分子，但是其分布的位置不同。细胞核遗传的遗传物质在细胞核中的染色体上；细胞质中的遗传物质在细胞质中的线粒体和叶绿体中。
细胞质遗传现象揭示了一个重要的事实，即细胞质内部存在着一种名为质基因的遗传物质，它掌控着某些特定的性状。然而，尽管科学家们在探索中曾试图通过电子显微镜寻找类似染色体的结构，但并未在细胞质内找到。
基因和细胞是什么关系
1、基因是DNA分子上的特定片段，承载着遗传信息。 DNA是构成染色体的遗传物质，位于细胞核内。 细胞核是细胞中的一个结构，负责存储和传递遗传信息。 细胞的功能不仅由细胞核决定，还受到细胞质中其他部分，特别是线粒体的影响。 线粒体是细胞内的细胞器，对细胞的能量代谢起着关键作用。
2、基因与细胞之间存在着紧密的联系。就个体内部而言，不同类型的细胞虽具有不同的功能与特性，但它们所拥有的基因是相同的。差异在于基因的表达，即转录与否。基因是DNA特定片段的命名，DNA是细胞核中的遗传物质，存在于每个细胞之中。基因可以分为结构基因与非结构基因。
3、在生物体内，基因与细胞之间存在着紧密的联系。基因，作为DNA序列上的特定片段，是构成遗传物质的基本单位。无论是细胞内哪一种类型的细胞，其内部所含的基因实际上是一致的，差异仅在于基因的转录活动。
4、就同一个个体来讲，他体内不同的类型的细胞所包含的基因都是一样的，只是在不同类型的细胞，有的基因转录，有的基因不转录，所以造成细胞类型的不一样。基因是DNA某个片断的名字，DNA是每个细胞里细胞核中的遗传物质。细胞与基因有什么联系新的生命是从一个细胞开始的。