1、细胞生物学博士学位。根据查询汤富酬个人简介显示,汤富酬2003年在北大获得细胞生物学博士学位,2004-2010年间在英国剑桥大学Gurdon研究所从事博士后研究,2010年作为PI回到北大,加入新成立的BIOPIC并组建实验室,主要从事人类早期胚胎发育的单细胞功能基因组学研究。
2、学历水平:我们知道能够被评为大学教授的一般都具有很高的学历,而且一般都为博士学历,学历越高,在职称评聘当中所占据的优势就更高。
3、科学家发现,肿瘤内部细胞类型与表达水平存在差异,仅以组织为单位研究,可能无法发现有效治疗靶点。单细胞分析揭示细胞间基因差异,精确用药可能取得更好疗效。单细胞转录组测序技术发展历程。早期受限于分离技术和测序通量,无法大规模分析。2009年汤富酬团队开创单细胞mRNA检测方法。
1、单细胞转录组测序揭示了细胞间的差异性,对疾病研究、药物开发和靶向治疗至关重要。科学家们通过单细胞分析,深入理解细胞异质性,比如肿瘤研究中,肿瘤中心与边缘细胞在基因表达水平上存在显著差异,这可能影响治疗效果。
2、转移过程涉及癌细胞与基质细胞之间通过细胞因子、生长因子和蛋白酶的分泌,促进转移性扩散。TME由复杂的细胞组成,包括不同类型的成纤维细胞和免疫细胞,它们在肿瘤逃避、转移及响应治疗中扮演重要角色。研究已鉴定出一些癌相关成纤维细胞(CAF)的亚型,包括促进和抑制肿瘤的亚型。
3、放在我们单细胞转录组的场景下,就是需要将一个 基因×细胞 的表达矩阵(V),分解成 基因×表达程序 (W),与 表达程序×细胞 (H)两个矩阵的乘积。如下图:在 基因×表达程序 矩阵中,存放的是每个program中,每个基因的权重, 往往根据权重最大的前20/30个基因来确定该program的功能 。
4、单细胞 RNA 测序技术进一步显示Myf5衍生细胞的高度异质性,并发现非肌原性细胞在没有SRSF2的情况下显著增加,反映出细胞命运的改变。此外,差异基因表达分析表明分化标志物Myog和p21上调,而Pax7和Myf5在分化过程中的异常表达。结果 敲降SRSF2导致成肌细胞的早熟分化并引起祖细胞的耗尽。
5、宫颈癌是最常见的妇科恶性肿瘤之一,研究者通过单细胞转录组学分析揭示了其细胞异质性和分子分层,为精准预后和治疗奠定了基础。这篇研究由Keqin Hua团队完成,他们使用单细胞技术,揭示了CC恶性细胞的广泛异质性,对宫颈癌的个性化治疗提供了新视角。
1、非常强的实验室。北京大学汤富酬实验室主要从事人类早期胚胎以及生殖系细胞发育的单细胞功能基因组学研究,做出了一系列国际前沿的成果,在国际上率先系统发展了单细胞功能基因组学研究体系,开启了单细胞转录组测序时代,建立了单细胞转录组高通量测序等技术。
2、年,本科毕业,取得学士学位后,李琳以优异的成绩被北京大学录取,师从汤富酬教授,主要研究人类早期胚胎发育的单细胞功能基因组学,开始了为期五年的硕博连读。在汤教授的实验室,每年都能稳定地发表数篇CNS论文,这是学科领域的顶尖存在。
3、人。汤富酬,男,1998年及2003年分别获北京大学生物学专业理学学士、博士学位。截止2022年9月26日,共培养了60名博士生。2016年8月获国家杰出青年科学基金资助,2016年11月获第九届谈家桢生命科学创新奖。2021年9月13日,获第三届“科学探索奖”。
1、Immugent今天就来解读特别的一类生信文章,姑且把它称为“生信综述”吧,因为我人微言轻,并不会我把它叫什么,以后都是这种叫法,就不绞尽脑汁想这个名字了。这类“生信综述”文章已经有很多年的发展史了,主要都是围绕对各种火爆一时(引领科研)的重大技术来展开,比如近些年火热的单细胞测序技术。
2、虽然不做实验,但是影像组学+单细胞多组学能轻松上10分;虽然不做实验,但是生信分析加点影像组学就能发到17+……影像组学自2016年以来一直是热点,因此发文量飙升,但规范的影像组学论文依然能发到非常好的杂志,这是因为影像组学的价值越来越被临床认可。
3、在肿瘤微环境中发现成纤维细胞。通过GEO数据库获取三个MESO样本的单细胞水平基因表达谱,共获得14,347个细胞用于后续分析。利用降维和聚类分析,识别了肿瘤微环境中的15个seurat群,并将其分为七种细胞类型。对15个seurat簇进行差异表达分析,确定marker基因。
4、结合空间转录组与单细胞分析,文章发表分数显著提高,甚至可以达到54+Nature子刊、40+Cell、13+可复制生信高分模板的水平。对空间转录组进行简单验证,文章的可接受度将更高。
1、高通量测序技术相较于第一代测序技术,其显著优势在于能够一次性处理大量样本,并产生巨大的数据量。第一代测序技术每次只能对单个样品的一段序列进行测定,数据量相对较小。而高通量测序技术则能够一次性产生几十至上百GB的数据量,大大提高了研究效率和规模。
2、高通量测序技术优点高效性高通量测序技术可以在短时间内处理大量样本,大大提高了测序效率。高通量测序技术缺点准确性差:高通量测序技术在处理某些类型的DNA序列时会出现偏差,导致结果的不准确性。
3、其次,转录组测序提供了更精确的数字化信号。与传统技术相比,高通量测序产生的数据更为精确,能够量化每个基因的转录水平,这在分析基因表达差异和调控机制时尤其有价值。这种精确度使得科学家能够进行更深入的统计分析,得出更为准确的结果。再者,高通量测序具有极高的检测通量。