1、Read length 读长:单个测序reads的长度,short-read RNA测序得到的长度通常是50-150 bp。Sensitivity 敏感性:样本中多大比例的转录本会被测到,敏感性越高,这一比例越高。它受样本处理、文库制备、测序和计算偏好性的影响。
2、de novo 测序(从头测序) :是指在没有任何参考基因组序列时对植物基因组进行测序和组装。 全基因组重测序 :全基因组重测序是对基因组序列已知物种的个体进行基因组测序,并在个体或群体水平进行差异性分析的方法。
3、对于哺乳动物基因组重测序、外显子测序,我们保证数据质量是Q30的比例高于80%。对于mRNA测序,smRNA测序,我们保证对照Lane的数据质量是Q30的比例高于80%。 一般情况下: 哺乳动物基因组重测序、外显子测序,GC比例在40%左右,Q30的比例是80~95%; RNA-seq,GC比例在50%左右,Q30的比例是~80%。
4、强光照射导致DNA酶变性,导致测序过程终止。3,文库本身长度,要做20-30k的文库难度很大。测序复合物:聚合酶,测序引物,测序模板。一个板上有15万个小孔,由于测序复合物的随机不均匀分布,约有1/3的孔是空的,1/3的孔是一个复合物,1/3的孔有两个及以上的复合物。
5、总结来说,随着测序深度的增加,单碱基偏差与泊松分布图的偏离程度会增大,显示出更高的精确度。基因组覆盖率在15X后增长放缓,趋于饱和。而map-rate虽然变化不显著,但深度确实会影响其稳定性。变异检测的专一性在8X时已经很高,但深度带来的灵敏性提升是显著且明显的。
6、转录组研究涉及RNA的全面分析,mRNA转录组测序则聚焦于mRNA的集合。此过程从组织或细胞样品的RNA抽提、纯化及构建文库开始,利用Next-Generation Sequencing技术,如Illumina HiSeq平台,对这些文库进行双末端测序。此操作旨在比较不同生物样品转录组,发现差异基因,为研究方向提供思路或验证假设。

1、密度 应该是专业术语的覆盖度 代表你测序的数据覆盖到基因组的多少(比如90%,即有10%的序列没有测到)。产量,专业术语叫通量,即测序的产出值,一般分为以下几个说法:多少G,即你测序多少G的碱基数,多少条reads,即你测了多少个读长(不同的测序平台读长不一样)。
2、高通量测序中,每测一个碱基会给出一个相应的质量值,这个质量值是衡量测序准确度的。碱基的质量值13,错误率为5%,20的错误率为1%,30的错误率为0.1%。Q20与Q30则表示质量值大于等于20或30的碱基所占百分比。比如一共测了1G的数据量,其中有0.9G的碱基质量值大于或等于20,那么Q20则为90%。
3、测序深度是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值。假设一个基因大小为2M,测序深度为10X,那么获得的总数据量为20M。覆盖度是指测序获得的序列占整个基因组的比例。由于基因组中的高GC、重复序列等复杂结构的存在,测序最终拼接组装获得的序列往往无法覆盖有所的区域,这部分没有获得的区域就称为Gap。
4、简洁版: 深度即:测序得到的总碱基数/基因组碱基数 。也可以理解为将基因组测了几遍。测序深度能减少假阳性和测序错误率。覆盖度原来是指基因/转录组上测序测到的部分占整个组的比例,但是现在很多人把coverage也直接当depth用了。
5、安诺三代微生物多样性是基于 PacBio 测序平台,利用单分子实时测序(SMRT Cell)的方法,平均读取长度可达20kb,HiFi读取准确率99%。
6、通量是指同时可以测的DNA样本数目的多少,一台第一代测序仪一次性最多只能测96个样本,而一台第二代测序仪(高通量测序仪)可以同时测数万个样本。一个读数(read)是指测序得到的一个碱基序列。
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5、要重新到Escode里打开Escreen界面,将General Radio里Enabled RATs改为CDMA 1X+EVDO。退出来后又显示3G 这样就可以打电话了。之后如果想上网直接打开数据服务就会回到4G(460-11)我一开始也是这样3G仅语音,只能打电话不能上网。这个方法亲测有效,但目前没找到两者兼得的方法,可以将就着用下。
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黑莓手机q20。黑莓q20采用了高通骁龙Snapdragon MSM8960双核处理器,处理器的主频率达到了5GHz。这款处理器与黑莓BlackBerry OS 3操作系统搭配,能够让黑莓q20运行流畅。
黑莓Q10:黑莓Q10的系统内核为BlackBerry OS 1。黑莓Q20:黑莓Q20的系统内核为BlackBerry OS 3。主屏尺寸不同 黑莓Q10:黑莓Q10的主屏尺寸为1英寸。黑莓Q20:黑莓Q20的主屏尺寸为5英寸。
没有啥差别的。配置方面,黑莓Classic(Q20)采用5英寸720p触控屏、大猩猩3代玻璃,搭载5GHz双核处理器,内置2GB RAM。同时,它还拥有16GB ROM、支持扩展,前、后置摄像头像素分别为200万和800万。依旧采用经典的QWERTY物理全键盘,近乎方形的触控屏和四大导航键(发送、结束、菜单以及返回)。
黑莓Q20采用直板式设计,配备5英寸电容屏,搭载BlackBerry OS操作系统,内置摄像头,支持QWERTY全键盘。